文章摘要:三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)是乳腺癌中恶性程度较高的一种病理分型,其病理的特殊性使得目前药物治疗效果不甚理想,探究与TNBC病变过程相关的病理标志物是当前乳腺癌研究领域的热点之一.通过美国高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库获取TNBC相关的基因集,并进行主成分分析、差异基因筛选、基因功能和信号通路的富集分析、蛋白互作网络构建以及加权基因共表达网络分析等转录组学分析.实验结果表明,TNBC和非TNBC具有明显不同的基因表达模式,这些差异基因主要富集于表皮生长和分化、乳腺上皮细胞生长和发育等相关生物学过程,转录因子结合相关分子功能与雌激素信号转导相关通路,以及综合蛋白互作网络和共表达网络的结果等;可以预测TFF1、FOXA1、AGR2、AGR3可能是涉及TNBC病理表型的关键基因.研究基于公共数据库TNBC基因集的转录组学分析,为揭示TNBC潜在的病理标志物,以及对由此衍生的疾病诊疗靶标或分子调控机制提供一定的理论研究依据.

文章关键词:转录组学,三阴性乳腺癌,公共数据库,基因芯片,生物信息学分析,病理标志物,

项目基金:浙江省科技计划项目国际科技合作一带一路专项项目(2017C04009),

论文作者:王平¹ 徐子金¹ 

作者单位:1. 浙江工业大学药学院 2. 义乌市中心医院药剂科 

论文分类号: R737.9

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